Prix Léopold Escande : prix de thèse de l’INPT qui récompense annuellement les 15 % meilleures thèses toutes disciplines confondues :
2001 : thèse de Vincent FARINES, thèse de Marie MORARD
2002 : thèse de Olivier ORLIAC
2003 : thèse de Christophe JACQUES, thèse de Gaëlle POULENAT, thèse de Laure CANDY
2004 : thèse de Caroline SABLAYROLLES

Prix Europol-Agro en 2004 pour les travaux de la thèse de Laure CANDY.

Prix du journal : Le Monde Scientifique en 2004 pour les travaux de thèse de Antoine ROUILLY-DAVIS.

Médaille CHEVREUL décernée par l’Association Française pour l’Etude des Corps Gras (AFECG) en 2004 au Dr Zéphirin MOULOUNGUI pour l’ensemble de ses travaux réalisés dans le domaine de la lipochimie.

Grand prix de l’Académie des Arts et des Sciences du Pastel (en 2005 pour les travaux de thèse de Dana CRISTEA).

Académie des Arts et des Sciences du pastel : en 2005, lors de la création de cette académie, le Dr Gérard VILAREM a été intronisé académicien et les Prs Antoine GASET, et Elisabeth BORREDON académiciens d’honneur, ceci pour l’ensemble des travaux de recherche effectué sur le Pastel depuis de nombreuses années au sein de l’UMR et du CRITT-CATAR.

Suite à la création des entreprises BOIS VALOR et VEGEPLAST par deux de nos anciens doctorants, respectivement Marie MORARD et Eric PEYRAT avec dans les deux cas une contribution du savoir-faire de l’UMR, plusieurs récompenses ont été attribuées à ces jeunes créateurs d’entreprise :
1er grand prix décerné par l’ADERMIP (Prix Michel BENECH) : en 2003 à la société VEGEPLAST, en 2004 à la société BOIS VALOR.
1er prix au salon national des jeunes entreprises innovantes décerné en 2004 à la Sté BOIS VALOR.
Prix innovation Bio et Techs décerné en 2005 à la sté VEGEPLAST.

Prix de l’Académie délivré par l’Académie des Sciences, Inscriptions et Belles-lettres de Toulouse récompensant les meilleurs travaux de recherche de l’année civile dans différents domaines (en 2006 pour les travaux de thèse de Caroline Sablayrolles).